| Datum | Paarung | Ergebnis | Bilder |
| 03.08.2003 | 1.FC Magdeburg - Anhalt Dessau* | 4:0 | - |
| 10.08.2003 | FC Oberlausitz - 1.FC Magdeburg | 2:1 | - |
| 15.08.2003 | FC Carl Zeiss Jena - 1.FC Magdeburg | 2:0 | - |
| 14.08.2003 | 1.FC Magdeburg - FV Dresden 06 Laubegast | 2:1 | - |
| 27.08.2003 | FSV Zwickau - 1.FC Magdeburg | 1:0 | - |
| 07.09.2003 | 1.FC Magdeburg - VfB Pößneck 09 | 2:1 | - |
| 13.09.2003 | VfB Auerbach - 1.FC Magdeburg | 0:0 | - |
| 21.09.2003 | 1.FC Magdeburg - Germania Halberstadt | 3:0 | - |
| 27.09.2003 | FC Erfurt-Nord - 1.FC Magdeburg | 0:2 | - |
| 05.10.2003 | 1.FC Magdeburg - FC Energie Cottbus II | 2:1 | - |
| 11.10.2003 | Eintracht Sondershausen - 1.FC Magdeburg | 1:1 | - |
| 19.10.2003 | 1.FC Magdeburg - VfB Leipzig* | 2:1 | klick |
| 25.10.2003 | Dredner SC - 1.FC Magdeburg | 1:2 | - |
| 02.11.2003 | 1.FC Magdeburg - SV 1919 Grimma | 3:0 | - |
| 14.11.2003 | Hallescher FC - 1.FC Magdeburg | 1:1 | klick |
| 21.11.2003 | 1.FC Magdeburg - VFC Plauen | 1:1 | klick |
| 29.11.2003 | FV Dresden Nord - 1.FC Magdeburg | 0:0 | - |
| 07.12.2003 | Anhalt Dessau - 1.FC Magdeburg* | 2:3 | - |
| 01.02.2004 | 1.FC Magdeburg - FC Oberlausitz | 1:0 | - |
| 08.02.2004 | 1.FC Magdeburg - FC Carl Zeiss Jena | 1:0 | klick |
| 14.02.2004 | FV Dresden 06 Laubegast - 1.FC Magdeburg | 0:3 | - |
| 22.02.2004 | 1.FC Magdeburg - FSV Zwickau | 3:0 | - |
| 06.03.2004 | VfB Pößneck 09 - 1.FC Magdeburg | 0:0 | - |
| 14.03.2004 | 1.FC Magdeburg - VfB Auerbach | 3:0 | - |
| 21.03.2004 | Germannia Halberstadt - 1.FC Magdeburg | 0:0 | - |
| 28.03.2004 | 1.FC Magdeburg - FC Erfurt Nord | 3:0 | - |
| 07.04.2004 | FC Energie Cottbus II - 1.FC Magdeburg | 0:1 | - |
| 04.04.2004 | 1.FC Magdeburg - Eintracht Sonderhausen | 4:0 | - |
| 17.04.2004 | VfB Leipzig - 1.FC Magdeburg* | 0:6 | - |
| 25.04.2004 | 1.FC Magdeburg - Dresdner SC | 5:0 | - |
| 02.05.2004 | SV 1919 Grimma - 1.FC Magdeburg | 0:0 | - |
| 08.05.2004 | 1.FC Magdeburg - Hallescher FC | 4:1 | klick |
| 16.05.2004 | VFC Plauen - 1.FC Magdeburg | 1:0 | - |
| 23.05.2004 | 1.FC Magdeburg - FV Dresden Nord | 3:2 | - |
